Borrar carpeta especial WinServer2003R2

[siul85]

Buenas, les explico mi problema. Tengo un WindowsServer2003R2 con dos HDD y en uno de ellos (es el de seguridad y donde NO está instalado WinServer) hay tres carpetas: Windows, ProgramFiles y PERSONAL, pues bien la cosa es que necesito borrar solo las dos primeras (Windows y ProgramFiles) sin perder la carpeta PERSONAL. Las carpetas a borrar son de un sistema Windows antiguo que el usuario no eliminó en su día e instaló el HDD en el servidor y ahora la quiere borrar sin tener que formatear el HDD. La cosa es que al ser dos carpetas "especiales" eliminándola de la manera cotidiana no funciona y recuerdo que había que hacerlo de una manera un tanto especial (creo que usando comandos de consola). ¿alguien podría ayudarme a borrar estas dos carpetas sin ningún riesgo para la carpeta PERSONAL?

Gracias de antemano.

[baduser]

Puedes hacerlo arrancando la maquina en Modo Seguro F8, solo asi podras borrarlas...

salu2

[Mikan]

toca borrarlas, sin que se carge el sistema, como te dice @Baduser, en modo seguro. o un livecd.

[siul85]

Gracias, lo probaré y os cuento, aunque creo que eso lo probé y no me dejó hacerlo, al menos en la versión sin R2, pero lo probaré para asegurarme.
Muchas gracias por las respuestas.